Joseba Zubeldia Agirre es un ex- ciclista español nacido el 19 de marzo de 1979 en la localidad de Usúrbil, en la provincia de Guipúzcoa (España).
Debutó como profesional el año 2002 con el Euskaltel-Euskadi, equipo desde 1998 de su hermano mayor, Haimar Zubeldia, y donde ahora había corrido previamente un año como amateur. Corre como gregario de este equipo. En la Euskal Bizikleta de 2004 quedó en el puesto 50 de la clasificación general. Desde 2005 su equipo participa en el UCI ProTour. Ha participado en grandes pruebas como el Giro de Italia.
Finalizó en el tercer puesto en la 4ª etapa de la Étoile de Bessèges de 2004 y fue también tercero en la clasificación final.
Se retiró tras la temporada 2007 tras permanecer toda su carrera en el Euskaltel-Euskadi.